我是倮倮，我来回答一下这个问题。题主的问题没有可比性，每一个地方都已自己的地域特点，肯定是有区别之处。而且这三座城市里有一座古城早已消失，所以也只能闲侃一下三座城市的不同之处，开篇之前，我们通过三张老照片缅怀传说中的昆明老城。
▲晚晴的昆明老城组图
丽江、大理、昆明三座城市，应该是在全国名气最高的三座省内旅游城市，三座城市都是由历史底蕴深厚的古城发展而来，特别是昆明和大理还是云南省首批二十四个历史文化名城。而丽江是第二批历史文化名称。从文化角度来看，丽江是纳西土司文化城市，大理是佛国文化城市，昆明是明清移民军屯文化城市。丽江古城从外形看，古朴而秀丽，因水而富有灵性。大理古城，方正古朴大气。但然旅游开放角度来看，丽江古城热度高于大理古城，物极必反，过度商业化，也给丽江古城带来了许多负面的影响，大理古城则相对好很多。总之两座城市都是云南旅游行业名气享誉中外的名片，两城古城的留存至今，显得弥足珍贵，为今天的人们回顾中国历史打开了一个记忆窗口。于此相反的就是昆明老城的消失。
从历史及后世留存度来看中国五千年的历史孕育出了大大小小数不清，因深厚的文化底蕴和发生过重大历史&政治事件而青史留名的城市。但是能留存至今，却不算多，其原因归纳起来很复杂，主要原因就是战乱、天灾、城市建设改造等等。本来从历史文明悠久来看三城：昆明>大理>丽江，但是很尴尬遗憾，从现今留存古城完整度来看，昆明不但比不了另外两座城，甚至比不了省内其他兄弟城市，这不得不说昆明已无资本和另外两城比较，因此，从古城留存和保护完整度看，应该是：丽江>大理>昆明（昆明可以说是直接出局）。
注解：拥有3000年文明历史的昆明开创了云南第一个青铜文明区。是当时最先进的地区之一。洱海地区也是云南人类早期繁衍区，但从文明发展成熟角度看，那时大理地区生活的多个民族部落，仍过着“无君长”的生活，政治、经济发展水平，整体不如滇池地区。丽江自更不必说了。位于西北角的丽江古代相对于闭塞，适合偏安，所以古城留存条件更为容易。三座城市留存完整度对比【丽江古城留存概述】
古代的丽江相对闭塞，半独立的土司制度加上远离频繁的政治斗争和战乱，近现代，也不是省级政治中心，发展大城市新城改造潮流对丽江影响有限。故丽江有较大几率完整的保留了（宋末元初）的古城（大研）格局，古城距近约750余年，是中国以整座古城申报世界文化遗产获得成功的两座古城之一。
注解：丽江古城现代修复部分主要是1996年2月3日丽江大地震损坏的。
▲丽江古城（网络）
【大理古城留存概述】
古代大理是云南700余年的政治中心，因此处于政治旋涡的大理古城，也因为历史的战乱等等，城市有过多次变迁。南诏国（太和城）和大理国（阳苴咩城）时期的古城早已消失，现存的大理古城格局是明朝洪武年间重建，距今天约600余年，历史不如丽江古城长，留存完整性也不如丽江古城。大理古城有部分区域已经被改造成很突兀的现代建筑。但是保护程度远比昆明好很多。▲大理古城（网络）
【昆明古城留存概述】
最尴尬和可惜的是昆明昔日的故城的消失，历史上昆明地区的处于滇中地区，曾是古滇国中心、益州郡的治所和元明清三朝的省级行政中心，南诏大理国时期，是国家的东都，因此一直是人口稠密的经济中心，政治军事斗争中心。自明朝军屯移民开始，昆明迎来最大移民潮，汉人首次超过本地土著，昆明也成为云南唯一的特大城市。回顾昆明早期城市发展轨迹，随着滇池水位和政权变更而变迁，从早期的滇池南岸发展到后期的滇池北岸。昆明由小变大至今，昆明也在旧城改造的大潮中迷失了，老城也改造的过程中消失了。这也是中国大部分城市老城区的结局。
昆明晚晴老城（网络）
【追溯历史，消失的老城】距离今天，最接近的昆明古城是明朝初期建立的云南府城-龟城，龟城格局延续到民国初年，未曾有太大的变化。龟城因为是省城，府城、县城三级治所地，因此昆明古城比较其他两城，城池更宽，街道更宽，城门也更高大和坚固。可惜现在只能从晚清驻昆外国人的照片，了解到昆明老城的荣光。所以昆明目前只能说，老城区保持了以正义路为中轴线的城市骨干框架没有变化，老城区仅仅零星的保留了部分历史建筑，和一些老街道地名。而城墙和古迹甚至许多老式民居，早已淹没在城市运动，新城建设大潮的浪花中。因此昆明市从2006年，开始改造和恢复昆明保留面积最大的连片老城片区，即昆明老街，但毕竟是商业营销过重，且是重修重建，所以至今争议很大。
▲明朝初建的云南府城——龟城
以自然环境来看上面说了三座城市的历史及古城发展与保护的概况。如果从自然环境来看，也挺有意思。云南作为旅游大省，自然环境丰富多彩。丽江、大理、昆明三座城市都是气候环境宜人的山水城园林城市，特别是大理和昆明市还是湖滨城市。古人建城选址，特别注重风水。以山为参考：三座城市各有特色，丽江古城位于高耸入云，雄伟挺拔的玉龙雪山之旁，大理古城旁是，巍峨雄壮的苍山，而早已消失的昆明古城旁边也有岩棉秀丽的西山睡美人。
▲丽江古城与玉龙雪山（网络）
▲大理古城与苍山
▲远眺西山睡美人
如果以水为参考来看：大理古城西畔靠美丽的洱海，而且从苍山还有溪流穿城流入洱海，昆明老城内盘龙江穿城而过，汇入宽阔的300里滇池。再说丽江古城，丽江古城虽未有高原大湖，但是丽江古城北面有一个水源，就是黑龙潭公园，黑龙潭水灵而清澈，水流以多条小河的方式汇入古城，一条条小河经过古城里一座座古朴的老桥，最后穿城而过，小桥流水衬托着纳西民居，显得古城特别雅致和宁静。由此丽江古城，虽然没有高大雄伟的城墙，却因为小河的汇入，多了水的灵性，这也是丽江古城区别于其他古城的灵魂所在。
▲黑龙潭公园
▲丽江古城
▲丽江古城
▲昆明老街福林堂
本文结束，喜欢/想了解更多云南/昆明交通发展，历史文化地方志，可以查看我的相关回答，本文结束，最后以昆明老街福林堂结束本文。谢谢观赏。
